(1)廷杖。廷杖即由皇帝下令，司禮監(jiān)監(jiān)刑，錦衣衛(wèi)施刑，在朝堂之上杖責(zé)大臣的制度。朱元璋在位期間曾將工部尚書薛祥杖殺于朝堂之上。明太祖死后，“廷杖”之刑被愈益廣泛地使用。明武宗正德初年，宦官劉瑾秉承皇帝旨意，“始去衣”杖責(zé)大臣，使朝臣多有死者。嘉靖年間因群臣諫爭“大禮案”，被杖責(zé)的大臣多達134人，死者竟有16人。至明亡前崇禎皇帝也沒有停止杖責(zé)大臣的制度�；实鄯ㄍ庥眯�，加深了統(tǒng)治集團內(nèi)部矛盾，對法制實施造成惡劣影響。
(2)“廠”、“衛(wèi)”特務(wù)司法機關(guān)。這既是明代司法的一大特點，又是明代的一大弊政。“廠”是直屬皇帝的特務(wù)機關(guān)。“衛(wèi)”是指皇帝親軍十二衛(wèi)中的“錦衣衛(wèi)”，下設(shè)鎮(zhèn)撫司，由皇帝任命親信“提督”廠衛(wèi)，多由宦官充當。廠衛(wèi)干預(yù)司法始于太祖時期，洪武十五年(公元1382年)太祖始令錦衣衛(wèi)負責(zé)刑獄與緝察逮捕。錦衣衛(wèi)下設(shè)南、北鎮(zhèn)撫司，其北鎮(zhèn)撫司“專理詔獄”，按旨行事，并設(shè)法庭監(jiān)獄。盡管太祖后期曾加禁止，但成祖很快恢復(fù)，成祖時“恐外官徇隋”，設(shè)宦官特務(wù)機構(gòu)“東廠”，專司“緝訪謀逆，大*惡”，其權(quán)超過錦衣衛(wèi)。憲宗時又為監(jiān)督廣、衛(wèi)而設(shè)“西廠”，至武宗為監(jiān)督東西廠，又設(shè)“內(nèi)行廠”。明末曾下令盡毀錦衣衛(wèi)刑具，不許再用。到明后期，廠衛(wèi)特務(wù)多達十余萬，嚴重地干擾了司法工作：其一，奉旨行事，廠衛(wèi)作出的裁決，三法司無權(quán)更改，有時還得執(zhí)行;其二，非去逮捕行刑，不受法律約束。
