深圳海關的職能是：依法對經(jīng)深圳口岸進出境的貨物、運輸工具、行李郵遞物品等進行監(jiān)管；征收關稅和其它法定由海關征收的稅費；查緝走私；開展貿(mào)易統(tǒng)計并辦理其他海關業(yè)務。
深圳海關旅檢業(yè)務占全國55%，加工貿(mào)易監(jiān)管占全國1/5,快件監(jiān)管業(yè)務占全國1/3，稅收征管約占全國9%,運輸工具監(jiān)管約占全國70%。
深圳口岸是全國最繁忙的口岸之一，深圳海關也是全國任務最繁重的海關之一，深圳海關以自身特有的位置，在新中國經(jīng)濟和社會建設的各個時期都發(fā)揮了重要作用。改革開放以來，深圳海關主動適應經(jīng)濟特區(qū)發(fā)展需要，深化業(yè)務改革，加強隊伍建設，不斷完善和改進自身工作，促進地方經(jīng)濟發(fā)展。