深圳海關(guān)的職能是：依法對經(jīng)深圳口岸進出境的貨物、運輸工具、行李郵遞物品等進行監(jiān)管；征收關(guān)稅和其它法定由海關(guān)征收的稅費；查緝走私；開展貿(mào)易統(tǒng)計并辦理其他海關(guān)業(yè)務(wù)。
深圳海關(guān)旅檢業(yè)務(wù)占全國55%，加工貿(mào)易監(jiān)管占全國1/5,快件監(jiān)管業(yè)務(wù)占全國1/3，稅收征管約占全國9%,運輸工具監(jiān)管約占全國70%。
深圳口岸是全國最繁忙的口岸之一，深圳海關(guān)也是全國任務(wù)最繁重的海關(guān)之一，深圳海關(guān)以自身特有的位置，在新中國經(jīng)濟和社會建設(shè)的各個時期都發(fā)揮了重要作用。改革開放以來，深圳海關(guān)主動適應(yīng)經(jīng)濟特區(qū)發(fā)展需要，深化業(yè)務(wù)改革，加強隊伍建設(shè)，不斷完善和改進自身工作，促進地方經(jīng)濟發(fā)展。